DNS szekvenálás

Alkalmazási területek / DNS szekvenálás

DNS ALAPÚ SZEKVENÁLÁS ÉS APPLIKÁCIÓK

 

Az új generációs szekvenálás (NGS)i eljárások felhasználhatók bármely szervezet DNS szekvenciájának meghatározására, értékes információkat szolgáltat szinte minden biológiai kérdés megválaszolásához.

Az NGS nagymértékben skálázható, alkalmazható kis, célzott régiókra vagy az egész genomra. A teljes genom szekvenálás (WGS) egy átfogó módszer nemcsak az emberek, hanem bármely faj teljes genomjának elemzésére, mint például a mezőgazdasági szempontból fontos állatállomány, növények vagy betegséggel kapcsolatos mikrobák.

A teljes exom szekvenálás (WES) az egyik legszélesebb körben alkalmazott célzott szekvenálási módszer, amikor az exomot (a genom fehérjét kódoló régiója) vizsgáljuk. A WES költséghatékony alternatíva a WGS-hez képest, mivel az exome a genom kevesebb mint 2% -ának felel meg, de a betegségekkel kapcsolatos változatok ~ 85% -a kódoló régióban található.

Minta követelményei

 

Teljes genom szekvenálás (rövid szekvenciák)

  • ajánlott: genomi DNS, ≥600 ng, 20 µl, nem töredezett
  • minimum: 200 ng, 15 µl

Teljes genom szekvenálás (hosszú reads)

  • ajánlott: genomi DNS, ≥2000 ng, 50 µl, nem töredezett
  • minimum: 1000 ng, 15 µl

Teljes exom szekvenálás

  • ajánlott: genomi DNS, ≥600 ng, 20 µl, nem töredezett
  • minimum: 150 ng, 15 µl

 

 

Munkafolyamat

Kapcsolatfelvétel
Kapcsolatfelvétel

order@ibioscience.hu
+36 70 674 6611

Projekt szervezése
Projekt szervezése
project egyeztetés, árajánlat, szerződés, szervezés
Mintabeküldés
Mintabeküldés
izolátum, szövet, vér
Mintafeldolgozás
Mintafeldolgozás
mintaelőkészítés, izolálás, könyvtárkészítés, szekvenálás
Bioinformatikai elemzés
Bioinformatikai elemzés
nyers adat QC, szűrés, térképezés, downstream elemzés
Eredményközlés
Eredményközlés
nyers adatok átadása, QC riportok, összefoglaló riport

Szekvenálási stratégia

 

Teljes genom (rövid szekvenciák):

  • 250-350 bp inszert könyvtár
  • paired-end 150 bp szekvenálás
  • ≥1000x lefedettség

Teljes genom (hosszú szekvenciák):

  • 20-30 Kbp inszert könyvtár
  • ≥30x lefedettség

Exome Sequencing:

  • 200-300 bp inszert könyvtár
  • paired-end 150 bp szekvenálás
  • ≥50x lefedettség

 

Ajánlatkérés