RNS szekvenálás

Alkalmazási területek / RNS szekvenálás

RNS ALAPÚ SZEKVENÁLÁS ÉS APPLIKÁCIÓK

 

A transzkriptomika, beleértve a hírvivőt, a mikro- és hosszú, nem kódoló RNS-szekvenálást, rendkívül érzékeny megoldás a génexpresszió mérésére.
Az RNS szekvenálás nagy felbontású rálátást biztosít a génexpressziós profilokra.
A transzkript izoformák, génfúziók, egyetlen nukleotid variánsok detektálhatók anélkül, hogy célzott RNS szekvenálási megközelítésre lenne szükség.
A kis RNS-ek szekvenálása betekintést nyújthat a transzkripció utáni szabályozásba és géncsendesítésbe, az izoformák, valamint a különböző mikro-RNS, valamint a kis, nem kódoló RNS-molekulák expressziós adatainak kimutatásával.

Minta követelményei

 

mRNS szekvenálás

  • ajánlott: totál RNS, ≥1000 ng, 10 µl, RIN >7
  • minimum: 200 ng, 10 µl

Kis RNS szekvenálás

  • ajánlott: totál RNS, ≥1000 ng, 15 µl, RIN >7
  • minimum: 1000 ng, 30 µl

Teljes transzkriptom szekvenálás

  • ajánlott: totál RNS, ≥2000 ng, 50 µl, no degradation
  • minimum: 200 ng, 10 µl

Munkafolyamat

Kapcsolatfelvétel
Kapcsolatfelvétel

order@ibioscience.hu
+36 70 674 6611

Projekt szervezése
Projekt szervezése
project egyeztetés, árajánlat, szerződés, szervezés
Mintabeküldés
Mintabeküldés
izolátum, szövet, vér
Mintafeldolgozás
Mintafeldolgozás
mintaelőkészítés, izolálás, könyvtárkészítés, szekvenálás
Bioinformatikai elemzés
Bioinformatikai elemzés
nyers adat QC, szűrés, térképezés, downstream elemzés
Eredményközlés
Eredményközlés
nyers adatok átadása, QC riportok, összefoglaló riport

Szekvenálási stratégia

 

mRNS szekvenálás:

  • 250-350 bp inszert könyvtár
  • single-end 75 bp szekvenálás
  • ≥10M szekvencia

miRNA szekvenálás:

  • 40 bp inszert könyvtár
  • single-end 75 bp szekvenálás
  • ≥10Ms szekvencia

Teljes transzkriptom:

  • 250-300 bp inszert könyvtár
  • paired-end 75 bp szekvenálás
  • ≥50M szekvencia

 

Ajánlatkérés